AI設計ウイルスが薬剤耐性感染症の治療に使用：わかっていること

2026年10月20日、バイオテクノロジースタートアップのRadical Numericsは、Omnii-1と呼ばれる人工知能モデルを使用してバクテリオファージ（細菌に感染して殺す病原体）を設計し、その組み換えファージを抗生物質耐性の大腸菌（Escherichia coli）感染を持つ患者に投与したと述べた。同社は、AI設計ファージが人間の患者に投与されたのは初めてのことだと説明している。

この話題がニュースになっている理由

Radical Numericsは同日、秘密期間から5,000万ドルのシード資金と、マルチモーダルゲノム言語モデルと呼ぶOmnii-1の公開発表とともに現れた。同社によると、Omnii-1はDNA、RNA、タンパク質、エピジェネティック信号を含む28種類の生物学的データで訓練されており、ファージ設計に加えて、病気を引き起こす遺伝的変異の予測、個別化された癌ワクチンの設計支援、新興の生物学的脅威の検出に使用できるという。

ファージ治療は医師主導の単一患者拡大アクセス（一般的に人道的使用として知られている）の下で投与されたもので、米食品医薬品局（FDA）は他の治療選択肢がない患者に対してこれを認めている。Radical NumericsはFDAが使用を認可したと述べたが、ニュースが流れた際、同機関は公式なコメントをせず、同社はプライバシーを理由に患者の身元、治療医師、臨床結果を明らかにしていない。

Omnii-1がどのようにファージを設計したか

Radical Numericsが公開した技術文書によると、研究者らはT7から始めた。T7は、約40キロベースのゲノムを持つ、大腸菌に自然に感染する十分に研究されたバクテリオファージである。彼らはOmnii-1を使用して、T7が細菌表面に結合するために使用するタンパク質gp17の新しい変異体を生成しながら、ファージゲノムの残りの部分をそのまま保つ。目標は、患者から分離された特定の抗生物質耐性菌株に結合して殺すことができるファージを作成することだった。

同社は、室内試験において、11～15個のアミノ酸変化を持つAI設計変異体が、類似の変化を持つランダムに生成された変異体よりもはるかに成功裏に機能したと報告している。得られたファージカクテルは患者から採取された細菌に対してテストされ、投与前にインビトロで耐性菌株を排除した。

EvoからOmnii-1へ：急速に進む研究ライン

• 2025年：Arc Instituteの研究者らはEvo 2と呼ばれるAIモデルを使用して約700,000個のファージゲノム候補を生成した。GV Wireによると、285個が合成・テストされ、16個が室内実験で実行可能であることが証明された。
• 2026年10月20日：Radical Numericsは5,000万ドルのシード資金とともにOmnii-1を公開発表し、AI設計ファージによる患者の人道的使用治療を発表した。

Yahoo Financeによると、Radical Numericsのチーフエグゼクティブ・エリック・グエンは、このマイルストーンを個別化医療への一歩と位置づけ、この分野が既存の薬物検索から患者の特定の生物学に適合する治療の設計へ移行していると述べた。

証明されていないこと

Radical Numericsのファージ設計に関する技術報告書は独立したピア・レビューを受けておらず、同社は患者の臨床結果の共有を拒否している。FDAは発表をカバーする記者へのコメントを提供しなかった。ファージ療法自体は新しくない。GV Wireによると、それは1世紀以上前にさかのぼり、抗生物質耐性が増加する中で関心が再度高まっており、米国およびその他の地域で専門のクリニックが現在運営されている。しかし、AIモデルを使用して単一患者の耐性菌株用にファージをカスタム設計することは新しい。

ベイム氏は、治療が終了し、AI生成ウイルスが既存のファージと比べて実際にどれほど新しいかを検査できるまで、判断を保留すると述べた。

デュアルユース技術

Radical Numericsは、Omniiが生物防御用にも開発されていると述べ、新興の生物学的脅威の検出を支援するためのLawrence Livermore National Laboratoryとの協力を含み、同社は元防衛高官とMicrosoftのチーフサイエンティフィック・オフィサーを顧問に数えている。AIが1人の患者の感染症用の治療用ファージを作成することを可能にする同じゲノム設計機能は、同社自身の説明によると、機能的ウイルスを設計できるAIツールは原則として悪用される可能性があるため、同時に対抗するためのセーフガードを構築しようとしている技術である。